Ами командата си е вградена - просто пишеш в конзолата convert <volume> /fs:ntfs
Тъй като искаш да конвертираш активния дял, това ще стане при рестартирането на машината (също като chkdsk върху С:\, ако там ти е инсталиран Уиндоуса)

Take the highway to the end of the night...