Ако искаме този индекс да се ползва от читателя на български, все пак би било по-възпитано да не му оставяме номерата на страниците от оригиналния текст :)
За това нещо трябва да каже издателят - ако ще се издава на хартия. По-точно трябва да каже кой ще го прави този индекс. Защото Word не става за печат, а не е ясно софтуерът за предпечат дали може да импортира индекса и после да го създаде наново при необходимост.
А ако е за електронен вариант, не мисля, че изобщо има нужда от индекс. Не мога да се сетя четяща програма за какъвто и да е формат на документи, която да няма функция за търсене.
За второто - къде да се напише в скоби? В основния текст ли? Аз лично не бих го оставил така в основния текст, ако няма особено важни причини. Дори и за медицинските термини, които спомена, пак може да се избере единият вариант. Така че и аз се присъединявам към мнението да се уеднаквят термините из текста.

Боян