Значи ето как аз си обиасниавам всичко
1.Слад унищожаването на Смит в първата част Оракула го създава отново с доста по усъваршенстван код с които той може да взима контрол над всички в които проникне(самото проникване е някакъв вид вирус с който тои може да ги контролира)
Ако забелязахте преди да убие Оракола той я нарича "майко"
Със неговото създаване Оракула цели точно това което се получава накрая той да започне да контролира колкото се може повече компоненти в матрицата и да не може да бъде спрян от никого дори от изкуствения интелект.
Фактически накрая се получава точно това и това е ролята на Нео да отиде и да предложи "мир" като се опита да го спре. И тои е сигурен в това че ще го спре защото знае че когато Смит добие контрол над него ще е много по уязвим самото унищожаване предполагам е точно втора точка на предложеното по горе.

2.Самото унищожаване на всички машини по пътия се получава вследствие на това че Нео след като добива всички тези възможности тои може да контролира самият сорс откъдето може да унишожава всички тези машини но все още няма достатъчно сила за да може да унищожи всички машини с едно щракване на пръста :)
Фактически той се намира както в реалният свият така и в матрицата по едно и съшо време.

Единствено ме издразни факта когато излиазоха на повърхостта и видяха слънцето и как едно толко еволюирали машини (изкуствениа интелект) не могат да направат така че да махнат обвивката над земията и да ползват слънцето от което те ще могат да черпят енергия и фактически така идеята на самата матрица и на използването на хората в нея се обезмислия.


Но както цяло това според мен това е филма на всички времена и като ефекти и като замисъл.
Първата част поставя много въпроси на които не дава точни отговори и затова е толко харесван от всички нас.
Но не мисля че втората и тертата част са били слаби дори напротив поне аз получих това за което платих.
Matrix rulezzzz