Интересно. Виж аз как го разбрах:

Според мен идеята е Изборът.

Независимо колкопластова е Матрицата, тя е заключена в съзнанието.
Клишето "роб на машините" всъщност е робство на обстоятелствата.
Точно това робство се троши с Изборът.
В цялото действие Нео прави избори - бял заек, път, хапче, операция "Морфей", Тринити или Зион и т.н.

Той е the One, защото не избира според обстоятелствата, а със сърцето си (баси, разчувсвах се, хлъц, хлъц). С други думи той прави човешки избор - води се от чувствата си, а не от логиката на обстоятелствата. А обстоятелствата са манипулирани от машини/програми/Матрица така, че по-логичен и естествен да е неправилният избор.

Обвързването с Матрицата или Зион го товари с логични обстоятелства, които манипулират избора му. А той се бори за свободата на съзнанието си.

После машините ще видят красотата на човешките чувства/съзнание (те логика си имат хехеее) и някои от тях ще минат на страната на хората.
Или пък по друг начин казано, той ще надвие обстоятелствата.

Абе изобщо - к'во ли исках да кажа....
А, да - наздраве!