Първо една добра новина - в Ysearch реших да напиша пълния хаплотип на нашия човек, въпреки че обикновено с базовите 12 маркера е достатъчно да се види близостта към някоя група ...
... и О ЧУДО - почви се човек който е тестван във FTDNA, но не е в нашия проект нито в този на Е-М35. Този човек пише че е тестван положителен за V13 и произхожда от Палатово!!! Не сме го забелязали по 12 маркера заради леката специфика на тестваните маркери, не е тестван за DYS389ii, за това пък е тестван за изключително рядко използвания DYS19b, така в списъка по 12 маркера е бил някъде из многото дадени като разлика 2 мутации и не сме му обърнали внимание, тъй като са много:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Редактирано от DarkBulgarianSubject на 20.06.13 12:14.

Не се раздвай, това си е Потр, само че при автоматичното прехвърляне на резултата от ФемилиТри има бъг, трябва да се логва в профила си и да се поправи маркерите. За този проблем бе вече съобщено във форума на фемилиТри.

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

За анабаптистите инаше нещо, че първо са забягнали в Русия - Украйна ли беше, а след това са се изселили в Америка. Затова имат доста "славянски" заемки. Това беше обсъждано по руските форуми, но не си спомням подробности.

Ами прочети статията, изследването е само на тези от Словакия, но всички са що годе с един произход.

Какви доста "славянски" заемки имат? Четирима R1a с 3 хаплотипа от 39 човека. А R1a не е и гаранция за "славянство", италианските едва ли са от "славяни", в западна Европа има и в малки количества от скандинавские/нормадските, за съжаление само с 12 маркера по R1a не може да се работи.

Европейските Е-та и R1b предполагам са им още от Швейцария.

Ето сайта на швейцарските анабаптисти, които би трябвало да са източника, ако ви се занимава може да си поиграете да проверите дали уникалните хаплотипове не са близки до някои от този сайт:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Ами аз в техния форум не съм влизал.

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Относно открити клонове под E-V13, досега всички българи бяха отрицателни за наличните за тест на ФемилиТри.
Но на Дженографика е открит един нов, доста многоброен подклон E-CTS9320, но братовчед ми от Сливен не е сред тях, остава си E-V13*, или E-PF2217.
Сред новите E-CTS9320, обаче има 2 анонимни българи, които са споделили "историите" си. За съжаление на Дженографика няма как да се свържеш със съвпаденците си.

E-CTS9320 etzvetanov My father is from North East Bulgaria. He has features, which differ a bit from the people in the region. His nose is more like Middle-Eastern. The other features are comparatively similar to the average features of the people in the region. He has 1/4 DNA coming from Romanians, who crossed Danube during the Middle Ages Plague and settled around the region where he originates, so I suspect that this has some influence on my genetic profile, being different from the average Bulgarian DNA profile.

E-CTS9320 MilenDG A Bugarian living in Sofia. Hp Group E-CTS9320. The earliest paternal ancestor is Delyu Keranov, born round 1860 in the Trace region village close to Maritsa river and Sakar mounain and cities of Harmanli, Haskovo and Odrin (Edirne in Turkey).

На Дженографика виждам общо 17 такива, има доста от Украйна, гърци и албанци.

Всъщност новото дърво за V13, според резултатите от проекта 1000 генома е следното:


V13---------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------Z5018----------------------------------------------------------------PGP132, HG01308
--------------------------------------CTS919/CTS2791/CTS3927/CTS9552------------------------NA20510
--------------------------------------CTS822----------------------------------------------------NA20528
--------------------------------------CTS299----------------------------------------------------HG01107
--------------------------------------L17/Z351---------------------------------------------------HG01054
--------------------------Z5016/Z5017-----------------------------------------------------------
--------------------------------------PF4805/CTS5415/CTS7903----------------------------------NA20516
--------------------------------------CTS9320/CTS3699/CTS4122/PF3263-------------------------HG01072

Засега ФемилиТри не тества никое от от новите снипове.

Някои хора пък се трудят по дървото на всички хаплогрупи според резултатите от Гено 2.0, защото Спенсър Уелс все се бави да ги публикува, макар да бяха обещали за март.
Дървото на Крис Морли може да си свалите от тука:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Т.е. Фенке тези хора са си 13, но също така и подгрупа?

Да, това е нова подгрупа на V13, която още не е включено в официалното дърво:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Аха много интересно. Фенке би ли споделила как излизаме на 23 и Фамили Файндър, от другата тема се разбра,че едните са се изложили много с ТРТР

Подреждах си регистъра на свалените публикации и други, както и обхождах блога на
и това ме заинтригува, пък видях, че темата е за Е, и реших вместо да отварям нова тема да го споделя тук

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Не знам защо, но ми се върти, че беше публикувано и цялото изследване, но не мога да го намеря.
Свалила съм си, обаче данните от това:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Редактирано от genefan на 05.01.14 12:29.

Браво! Ха сега да докажат че Арменците не са и от Америка!)

Весела и ползотворна година!

Това което цитирам е от Юни 2013, а Sub-population structure evident in forensic Y-STR profiles from Armenian geographical groups е от Март, явно ще са различни неща

Съавтор е Peter Ara Hrechdakian, попитах го кога ще го публикуват и че се интересувам от как тези 8% се разпределят между E1b1b1a1b-V13, E1b1b1a1a-V12 and E1b1b1a1c-V22. Като отговори ще споделя

Според мен арменците имат най вече Е-М123, а иначе другото Е ще е главно V13, поне аз така мисля

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Ами аз мисля, че авторите на абстракта са събрали данните от 413 арменци от публикацията за Арменското плато, коя

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

За Субекта, оказва се, че сред арменците има повече J2b1, отколкото J2b2. Арменска връзка?


J2b1 и J2b2 има от Индия до Западна Европа. На Балканите J2b1 не се ограничава само до нас и сърбите, от изследването на армъните поне по хаплотипове има един аемън и един албанец, нормално е румънците и гърците също да имат. M205 все още е малко тестван и използван снип и вероятно доста от J2b* по различните изследвания да са били М205.

В Арменския проект на М78* какво значи "negative for all the branches"?

Весела и ползотворна година!

А какви са тези "А"-та в Арменския проект?

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Получих STR маркерите на N117110, който се е тествал преди това с Genebase.
Макар маркерите да не съвпадат абсолютно с ФемилиТри, при 37 е най-близо до 274490 Христов и N108487 Стоименов
393 390 19 391 385a 385b 426 388 389-1 392 389-2 458 459a 459b 455 454 447 437 448 449 460 gatah4 ycaiia ycaiib 607 570 442 438
13 24 13 10 16 18 11 12 13 11 30 15 9 9 11 11 26 14 19 31 10 11 19 21 15 19 11 10

Тyй като той е доказан CTS9320, предполага се, че и други с подобни хаплотипи може да са от този клон.
Които се интересуват къде попадат под V13, може да си поръчат този маркер, аз го изисках и сега е включен в поръчките за SNP на Advanced Orders.
Впрочем, Пилар е поръчала вече Big Y за Христов и сигурно ще се намери още за този клон.
Нещата на Хаплозоната, обаче не ми харесват. Изглежда има някакъв конфликт между модераторите и резултатите от Е35 проекта вече не се прехвърлят автоматично там. Останаха само някои ентусиасти да събират резултатите от Гено 2.0, за някои клонове като E1b1b1c нещо се върти, но за V13 не виждам никой да действа.

А този маркер пак ли няма нищо общо с STR-ите?

Весела и ползотворна година!

Уви, Евгени Делев е CTS9320-.
Явно не е толкова лесно да се оцели кой е кандидат за положителен. При 12 маркера, поне половината български V13 са много близки до този от Genebase.

фенке, дай линк, нещо все не мога да открия къде се намира страницата където да се прочее историята попълнена от участниците

Участниците пишат история?

Весела и ползотворна година!

А коя мутация те определя като V-13?

Весела и ползотворна година!

А коя мутация те определя като V-13?

V-13

SNP, в този случай върху Y хромозомата се определят като мутации на нуклеотидите на определена позиция.
Наименованието е условно и зависи от коя научна лаборатория е открито.
Ако не ви мързи да се ровите, ето списък на откритите досега. Очаква се "затъване" в нови SNP след масовото излизане на резултатите от пълното секвениране на У хромозомата.

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Това на 'общий вид' метри ли са?

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Намерих и това по-ново, където изглежда фигурират същите данни, но е с платен достъп:
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1344622312001666

Качила съм статията за 1 месец тук:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Изглежда самите арменци напират да са дощли от Европа - чрез Балканите, макар генетичните тетове да ги дават като едни от най-чистите анадолци, без смесване поне в последните 1500 години.

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Е, неолитната база на арменците са анадолци, които никъде на са ходили-ни на север през Кавказ, ни на северозапад към Балканите. През късния Бронз-ранното Желязо към анадолците са се присъединили прогонените от Балканите ранни бронзови зеселници, които реално се завръщат след като са обиколили Черно море за няколко хиляди години. Христянската религия ги е предпазила от смесване с околните мюсулмани, защото сменилите религията са сменили и народноста-сега са турци или азербайджанци.

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Първия български Big Y резултат излезе и е хубаво, че е от най-популярната група E-V13. Това е роднината на Пилар Христов Kit No: 274490.
Почвам да проучвам резултатите, засега е ясно, че е положителен за новия снип под V13 CTS9320. Повечето българи, тествани с Гено 2.0 са също положителни за него, изглежда това е типичния балкански кластер.
Тук може да си изтеглите файла с последните открития за E-M35:

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Грешка, Христов не е CTS9320. Засега не мога да открия да е положителен за някое от известните снипове под V13.

274490 донякъде той е по-различен от 274487 - имат GD 1 на 12 маркера и от там се разделят.

274487 постоянно получава съвпаденци на 12, докато 274490 не.

Нищо чудно 274490 да определя друг клон под V13

Known SNP - High confidence - 679
Known SNP - Medium confidence - 12
Known SNP - Unknown confidence - 4

Novel - High confidence - 230
Novel - Medium confidence -14
Novel - Unknown confidence - 0

поисках файла

от ISOGG 2014 tree

CTS7677/L930/PF1729, CTS6834/L931/PF1718, L1019andL1020are located downstream from E-V13 and may be phylogenetically equivalent to each other. Listed 18 August 2012.

резултати на 274490

L930 +
CTS7677 no call
PF1729 no call
CTS6834 no call
L931 +
PF1718 no call
L1020-

L930 се доказа на ниво М35. Не гледай ISOGG, който е приел само някои от новооткритите SNP.
Движи се по най-новото дърво, за което ти изпратих линк. Достоверни са данните по проекта 1000 генома и донякъде Гено 2.0, а някои SNP, открити от FamilyTree и другаде "висят" отдолу, като връзката им с другите не е ясна засега.
Христов е отрицателен за всички по-големи клонове, открити досега. Имам съмнения само за L540, който също е 'но кол'. Той се среща из Източна Европа и Германия, открит в доста хора.

Thank you for your request for the BAM file. I have made this request for you with the lab and will email once I have the link for download. Please note that the BAM file will be sent to the primary email on the kit requested only. Additionally, the process at this time may take up to two weeks to complete

Много добре, дано се получи скоро.
Аз се задълбах в неговите Novel SNP и открих по позициите, че много са публикувани и използвани от Chromo2 теста. Като анализирах съществуващите 15 V13 там, мисля, че той отива към новия клон S2978. Не можах да намеря да е положителен за това SNP, но е положителен за S2979(21834905), както семпъл №16 там, който е S2978+.
От този клон изглежда са открити сардинци.

какво ще правим без теб! злато си ти! добре, че имаш време да се задълбаеш...

Благодаря, насдявам се не иронизираш.
Това ме върна в старите програмистkи времена, даже трябваше да си припомня функциите на Ексел. Аз съм вече, както казват тук "retired" и мога да си вися цял ден пред компютъра.

въобще не иронизирам -

аз ги чаках с нетърпение резултатите - погледах ги час - два, поровичках се тук и там и се предадох - особено с novel - въобще нямам нерви да ги гледам един по един....

донякъде сме постигнали segreation of duties - от мен изследванията - от теб анализите - ако ти не правиш анализите за какво са ни резултатите....

Да, Big Y и прочие пълни геноми изискват вече професионална оценка и някакво автоматизирано класифициране на резултатите, не може визуално да се ровиш в десетки хиляди SNP.
От Хаплозоната има предложение да анализират резултатите на Христов, ако им изпратя файла с Raw data. Това е, което може да се свали в момента.
Затова разрешаваш ли, по принцип се изисква позволение резултатите да станат публични.

Разрешавам

На Хаплозоната пак брожения. Последно изгониха Стивън Бърд, който беше писал някаква статия, че уж английските Е-та са привнесени от легионери тракийци.
Все пак има един Алф, който се занимава по-сериозно с пълния геном. Пратих му файла на Христов, да видим какво ще се получи.

На Хаплозоната пак брожения. Последно изгониха Стивън Бърд, който беше писал някаква статия, че уж английските Е-та са привнесени от легионери тракийци.

Конкретно за това ли са го изгонили?

Ами не са го изгонили, но точно за тази статия го критикуваха, че уж новите данни не отговарят на един източник на Е-V13 в Англия.
След което той гордо сам обяви, че напуска форума.

И аз пак не разбрах кое ти определя групата, сниповете или СТР-ите?

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Стив ще публикува някъде из форумите ново дърво на Е-V13

ще изглежда по този начин

Tree.........V13...............................................................
........................................................................
..................CTS5856, CTS1273, Z1046, CTS9761......................................................
........................................................................
...........................Z5018.............................................
....................................Z16242....................................
........................................................................
....................................S2979....................................
........................................................................
.............................................FGC11451...........................
........................................................................
.............................................Z16659...........................
......................................................S2972..................
...............................................................Z16660/ALF605.........
...............................................................S2978.........
........................................................................Z16661/ALF612
........................................................................
....................................L17, Z16664, Z16665, Z16666....................................
........................................................................
...........................Z5016, Z5017.............................................
....................................CTS9320 + others....................................
.............................................S26015...........................
......................................................S19928..................

Всъщност 274490 разбива дървото със снип Z16659. Той е отрицателен за сниповете под Z16659. като тези положителни под него са и от 1KG Samples, PGP Samples и Francalacci Sardinians

фенке Дали 274487 е добър кандидат за CTS9320 или да изчакаме за Z16659, има ли някой в нашия проект CTS9320+?

Pillar, Христов е доказан, че лежи на друг клон от CTS9320, от тях имаме двама тесвани с Гено 2.0, но нямат STR маркери. Отделно поръчахме за Евгени Делев и той излезе отрицателен.
Мисля, Христов вече е доказан Z16659+, но ФемилиТри не тества засега Z5018, който стои на основния клон и за който той няма данни. Това го има в компанията на Кран, но трябва да се праща нова проба.

Sorry, нещо съм се объркала. Ако четеш Хаплозоната там има един Шмидт, който събира резултати за CTS9320. Досега не е открил някаква закономерност за кластериране и не може да се предскаже кой ще е положителен. Той беше строил преди дървета на хаплотипи близки до неговия и беше включил и моя братовчед Зарзалиев и някои други хора, които се доказаха, че са CTS9320-.
Но все пак голям процент от българите, тествани с Гено 2.0 излизат положителни, освен тези двамата в проекта, намерила съм и дриги двама с "истории", но няма как да се свържа с тях да се прехвърлят в ФТДНА.
Така че може да се пробваш за този снип, иначе трябва някой по-дълбок тест, даже Гено 2.0 не помага много за V13. Новото дърво има цял рояк подклончета под него като не е ясно дали се групират в по-големи клонове. Интересно защо липсва CTS9320, който все още се докладва като основен клон в Гено 2.0.
А хаплогрупите, ах, пак ги обновиха и пак има грешни и чертички.

А ако няма снип, какво има на негово място? И как така аз със 37 маркера съм само Е-М78?

Весела и ползотворна година!

вече си имаме доказан L791+, първия в проекта!


В голямото българско изследване има група Е-M34 – тя е с относителен дял от 1.9%. Снип L791 е под група на Е-M34.

И какво общо имат сниповете с СТР-ите?

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

В продължение на разговора от снощи

Проверих в NG - има само 27 лица, които да са CTS9320+ от тях само 3ма са българи (вече ако има други, които не са си попълнили историята... но пък тогава как ще разберем, че са българи....)

България се споменава 5 пъти при 2 лица, и още един с правописна грешка
E-CTS9320 etzvetanov
E-CTS9320 vladimirrazbin
E-CTS9320 MilenDG

на база горното бих се въздържала да направа заключение, че болшинството от българите от E-V13 са от този подклон....

Това са само българи, кити имат истории. Иначе от всички Е-та споменали, че са от България, трима са 9320 и само един, братовчед ми е от друг клон.
Има и няколко турци, но те не са V13.

Читаков FTDNA 344884 = YSEQ 930 чака CTS9320 в YSEQ. Според данните в E-V13 форума най-вероятно ще се окаже негативен. E-V13 групата в YSEQ: http://shop.yseq.net/group_alleles.php?gid=34

Говори се, че Хаплозоната поискала от ФемилиТри да включи още Снп от новото дърво на Алф, но засега нищо.

чакаме тези два снипа да са достъпни за тестване при FTDNA Z5016 and Z5018

ето и линка към форума

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

постинг на TRIFUD
Аз гледах в Ysearch, че има съвпаденци при ГД 3 на 25 маркера, но всичките са тествани и з 37 маркера, обаче при 37 маркера вече са на ГД 7+.

Въобще има ли някаква стратегия или съвет как да се подбират SNP при тази хаплогрупа. На Читаков пробата пристигна в YSEQ в събота и очаквам резултатите да пристигнат до края на седмицата, ако всичко е минало добре в лабораторията. Чудя се какво да му вземем, ако се окаже CTS9320-, както се предполага. Дървото на Алф има камара разклонения на едно и също ниво.

Ако е CTS9320- пробвай дали не е от другия клон - Z5018

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

Хаплозоната нещо не работи както трябва

ако сравнявам при 67 маркера 274490 - кит 274487 е на 12 разлика

сравня после 274487 пак при 67 маркера с - кит 274490 е на 14 разлика

Би трябвало независимо от кой с кого сравнявам да е една и съща разликата!

Генфен, да не казваш че хора с еднакви снипове са от различни групи?

Весела и ползотворна година!

И аз пак не разбрах кое ти определя групата, сниповете или СТР-ите?

SNP определя групата. При 37 STR маркера би трябвало да се знае дали е V13 или не. Кой е твоят кит?

И как така аз със 37 маркера съм само Е-М78?

При 37 STR маркера би трябвало да се знае дали е V13 или не. Кой е твоят кит?

CTS9320- е. Чакаме Z5018.

Тъй като изгубих нишката, къде съм поствала, че поръчах този тест за 274490, за това тук - в YSEQ тестът е положителен,

Z5016, Z5018 вече могат да се поръчват на ФемилиТри. Веднага използвах случая да поръчам 5018 за братовчед ми Зарзалиев, койго поне е доказан CTS9320- от Гено 2.0.
Както споменах преди, за повечето български V13 е игра на ези-тура от кой клон ще излязат. Има даже случаи на негативни и за двата снипа.

А вие сте доказани лъжеучени

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

YSEQ930 е CTS9320- и Z5018-. Вече не знам за какво да го тествам

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

В отговор на:

---

YSEQ930 е CTS9320- и Z5018-. Вече не знам за какво да го тествам

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите

---

Съдържаниет е скрито
Влезте за да го видите