Тестване на стара ДНК
80 отговора
0 прегледа
Re: Тестване на стара ДНК
Отново от [линк]
The very low levels of endogenous DNA remaining in most ancient specimens has precluded the shotgun sequencing of many interesting samples due to cost. For example, ancient DNA (aDNA) libraries derived from bones and teeth often contain <1 b="" by="" capacity="" dna.="" dna="" endogenous="" environmental="" is="" majority="" meaning="" of="" sequencing="" taken="" that="" the="" up=""> We will present a method for the targeted enrichment of the endogenous component of human aDNA sequencing libraries. Using biotinylated RNA baits transcribed from genomic DNA libraries, we are able to significantly enrich for human-derived DNA fragments. This approach, which we call whole-genome in-solution capture (WISC), allows us to obtain genome-wide ancestral information from ancient samples with very low endogenous DNA contents. We demonstrate WISC on libraries created from four Iron Age and Bronze Age human teeth from Bulgaria, as well as bone samples from seven Peruvian mummies and a Bronze Age hair sample from Denmark. Prior to capture, shotgun sequencing of these libraries yielded an average of 1.2% of reads mapping to the human genome (including duplicates). After capture, this fraction increased dramatically, with up to 59% of reads mapped to human and folds enrichment ranging from 5X to 139X. Furthermore, we maintained coverage of the majority of fragments present in the pre-capture library. Intersection with the 1000 Genomes Project reference panel yielded an average of 50,723 SNPs (range 3,062-147,243) for the post-capture libraries sequenced with 1 million reads, compared with 13,280 SNPs (range 217-73,266) for the pre-capture libraries, increasing resolution in population genetic analyses. We will also present the results of performing WISC on other aDNA libraries from both archaic human and non-human samples, including ancient domestic dog samples. Our capture approach is flexible and cost-effective, allowing researchers to access aDNA from many specimens that were previously unsuitable for sequencing. Furthermore, this method has applications in other contexts, such as the enrichment of target human DNA in forensic samples.
Тия май ще публикуват.
The very low levels of endogenous DNA remaining in most ancient specimens has precluded the shotgun sequencing of many interesting samples due to cost. For example, ancient DNA (aDNA) libraries derived from bones and teeth often contain <1 b="" by="" capacity="" dna.="" dna="" endogenous="" environmental="" is="" majority="" meaning="" of="" sequencing="" taken="" that="" the="" up=""> We will present a method for the targeted enrichment of the endogenous component of human aDNA sequencing libraries. Using biotinylated RNA baits transcribed from genomic DNA libraries, we are able to significantly enrich for human-derived DNA fragments. This approach, which we call whole-genome in-solution capture (WISC), allows us to obtain genome-wide ancestral information from ancient samples with very low endogenous DNA contents. We demonstrate WISC on libraries created from four Iron Age and Bronze Age human teeth from Bulgaria, as well as bone samples from seven Peruvian mummies and a Bronze Age hair sample from Denmark. Prior to capture, shotgun sequencing of these libraries yielded an average of 1.2% of reads mapping to the human genome (including duplicates). After capture, this fraction increased dramatically, with up to 59% of reads mapped to human and folds enrichment ranging from 5X to 139X. Furthermore, we maintained coverage of the majority of fragments present in the pre-capture library. Intersection with the 1000 Genomes Project reference panel yielded an average of 50,723 SNPs (range 3,062-147,243) for the post-capture libraries sequenced with 1 million reads, compared with 13,280 SNPs (range 217-73,266) for the pre-capture libraries, increasing resolution in population genetic analyses. We will also present the results of performing WISC on other aDNA libraries from both archaic human and non-human samples, including ancient domestic dog samples. Our capture approach is flexible and cost-effective, allowing researchers to access aDNA from many specimens that were previously unsuitable for sequencing. Furthermore, this method has applications in other contexts, such as the enrichment of target human DNA in forensic samples.
Тия май ще публикуват.
в отговор на DarkBulgarianSubject
#5
Re: Тестване на стара ДНК
Не знам дали това е във връзка с публикация пак на абстракт, че са правили изследване на трак от желяната епоха и приличал повече на Сардинец, а не на съсвременни българи.
Редактирано от genefan на
в отговор на Aulus Vitellius Celsus
#8
Re: Тестване на стара ДНК
Видя ли заключенията за етруските?
И какво става с твоя любим Рим?
Вторият етнообразуващ елемент изчезнал напълно!
Както е известно, митохондриално римляните са сабиняни.
Дай да видим дали е останало нещо от сабиняните, че и от латините?
Тук съм за да разговарям с философи, овце си имам!
И какво става с твоя любим Рим?
Вторият етнообразуващ елемент изчезнал напълно!
Както е известно, митохондриално римляните са сабиняни.
Дай да видим дали е останало нещо от сабиняните, че и от латините?
Тук съм за да разговарям с философи, овце си имам!
Re: Тестване на стара ДНК
[линк]
Още азиатски линии от Украйна - ще излезе че не фино-угрите са придошли от изток и са се смесили с "арийците", а че са си там поне от неолита, ако не и от по-рано.
След като Срубната култура все по малко прилича на кимерийска, както по всякакъв начин я изкарват руснаците, изглежда пътя на ИЕ езиците до Европа ще да е минавал на юг от Черно Море през Балканите. А индоевропеизацията на Северното причерноморие вероятно е станала чак 1200 пр.н.е. с идването на истинските кимери.
Още азиатски линии от Украйна - ще излезе че не фино-угрите са придошли от изток и са се смесили с "арийците", а че са си там поне от неолита, ако не и от по-рано.
След като Срубната култура все по малко прилича на кимерийска, както по всякакъв начин я изкарват руснаците, изглежда пътя на ИЕ езиците до Европа ще да е минавал на юг от Черно Море през Балканите. А индоевропеизацията на Северното причерноморие вероятно е станала чак 1200 пр.н.е. с идването на истинските кимери.
в отговор на Aulus Vitellius Celsus
#14
Re: Де ти го примера?
Това са все публикации отпреди година-две и са разисквани по ДНК форумите. Не знам защо Южнака чак сега се е заел да ги публикува.
Това за етруските е май от същия екип на проф.Карамело, дето ще изследва нашите стари мтДНК.
Полако/Давидски се похвали на коментарите под абстрактите, дето ги дава Диенекес, че има резултата на тракиеца от желязната епоха, откъде ли се е сдобил с него. Но, само от данни няма полза, ако не се сравнят с други съвместими.
Аз с него не говоря, защото е "рядко л...", както май става с някои хора на форум История.
Това за етруските е май от същия екип на проф.Карамело, дето ще изследва нашите стари мтДНК.
Полако/Давидски се похвали на коментарите под абстрактите, дето ги дава Диенекес, че има резултата на тракиеца от желязната епоха, откъде ли се е сдобил с него. Но, само от данни няма полза, ако не се сравнят с други съвместими.
Аз с него не говоря, защото е "рядко л...", както май става с някои хора на форум История.
в отговор на Aulus Vitellius Celsus
#15
Re: Тестване
То май и нашият народ ще сподели съдбата на Етруските, но това е др тема. Интересно, като се има предвид че някои учени са смятали Етруските сродни на Славяните. Основание за това са им дали вероятно някои думи като 'расна'- раса и 'цел' - почва, земя.
А пък гърците да не се правят много на европейци защото езикът им споделя общи думи с 'Дравидския' и Корейския.)
А пък гърците да не се правят много на европейци защото езикът им споделя общи думи с 'Дравидския' и Корейския.)
Re: Тестване
Псевдолингвисричните заключения на някои руски 'учени' са безобразна стъкмистика, която не е подкрепена с никакви доказателства относно Евентуалното родство между етруски и славяни. Подобни опити се правят навсякъде в бившите соцстрани, с цел профанизиране на историята и избиването на някакви национални комплекси.
Редактирано от Aulus Vitellius Celsus на
Re: Де ти го примера?
Не съм сигурна, дали това не е журналистическа партенка, но тук пише, че са правени ДНК тестове на неолитни кости от Ябълково и били сродни на Мала Азия:
ДНК анализи на хората, погребани край Ябълково, пък показа сходство с тези от Мала Азия. След сравнението на костните проби, които бяха направени в Ирландия, с пробите на находки от Йерихон, от селища в Анадолия, учените заключиха, че древните ябълковчани са дошли от Анадолия.
[линк]
ДНК анализи на хората, погребани край Ябълково, пък показа сходство с тези от Мала Азия. След сравнението на костните проби, които бяха направени в Ирландия, с пробите на находки от Йерихон, от селища в Анадолия, учените заключиха, че древните ябълковчани са дошли от Анадолия.
[линк]
Re: Де ти го примера?
По останките от сгради, в които живели 2-3000 души
Това си е сериозна бройка за онова време.
Според шефа на екипа Красимир Лещаков по трудоемкост изграждането на съоръжението край с. Ябълково може да бъде сравнено с труда по първите пирамиди.
Ай сиктир.
Анализите обаче сочат, че древните се били доста мързеливи, защото само около 3% от храната си набавяли с лов. Имали обаче питомни животни.
По тази логика дерибеите трябва да са сред най-работливите.
Неолитните дами от Ябълково пък били като двойнички на Николета Лозанова- около 1,60 високи, с много изтънчени черти и нежни кости.
Няма да повярвам докато не видя рентгенова снимка на Николета Лозанова.
Що се отнася до ДНК-то, или резултатите са съвсем пресни и не се е разчуло още, или журналиста се е объркал нещо, както се е случвало.
Това си е сериозна бройка за онова време.
Според шефа на екипа Красимир Лещаков по трудоемкост изграждането на съоръжението край с. Ябълково може да бъде сравнено с труда по първите пирамиди.
Ай сиктир.
Анализите обаче сочат, че древните се били доста мързеливи, защото само около 3% от храната си набавяли с лов. Имали обаче питомни животни.
По тази логика дерибеите трябва да са сред най-работливите.
Неолитните дами от Ябълково пък били като двойнички на Николета Лозанова- около 1,60 високи, с много изтънчени черти и нежни кости.
Няма да повярвам докато не видя рентгенова снимка на Николета Лозанова.
Що се отнася до ДНК-то, или резултатите са съвсем пресни и не се е разчуло още, или журналиста се е объркал нещо, както се е случвало.