Транскрипция на ДНК

Коя от двете нишки на двойната спирала се транскрибира в РНК? Какъв е критерия, чрез който се избира тя?

Opredeliasta e posokata: transkripciata vinagi e ot 5' kum 3' kraiat. Transkribira se obiknoveno tazi koiato nekodira - ta poluchenata RNK da e kodirasta (nali si spomniash za komplemntarnost i kodoni). Genite sa orientirani i v dvete posoki (na edna hromatida) taka, che i dvete nishki na edna dnka mogat da budat transkribirani (samo po edna nishka za gen razbira se).

Nadiavam se nesto da izleze ot kartinkata:


.....................................................................................RNK na gen1
.......................................................................... 3' <------------------------5'
5'----------------------------------------------------------------------------------------3'DNK
3'----------------------------------------------------------------------------------------5'DNK
5'----------------------->3'
RNK na gen2

Бих допълнил errata със следното:
Промоторът е контролният елемент, който определя коя от двете вериги да бъде транскрибирана от РНК-полимеразата. Субеденици от ензима разпознават промоторната последователност, което води до правилното позициониране на полимеразата (т.е. разпознавне на съответната верига и началната точка за транскрипция).
Както предполагам ти е извесно, промотора е секвенция (последователност), която се намира пред гена и определя освен гореизброените неща, така и честотата на транскрипция на гена. Промотора, както споменах, е контролен елемент, което означава, че не кодира продукт и не се транскрибира.

Всяка от двете може да бъде, нали са еднакви като инфо. А по какъв механизъм се избира едва ли е изяснено.

Че нали и двете вериги имат промотори, едва ли това или не само това е определящо, коя от веригите на дуплекса ще се транскрибира.

Пак ще се опитам да го обясня...
1)посоката на полимеразите е 5`-3`, т.е това е и посоката на транскрипция
2)тъй като ДНК е двуверижна, едната верига ще е значеща (сенс), а другата не (антисенс)
3)РНК-поли разпознава определена последователност, чрез която се определя положението на ензима и честотата на инициация на транскрипцията.
С други думи - определя се коя от двете вериги е значеща и колко често да се синтезира РНК. Напр ако имаш последователност ИВАН в едната верига и тя показва, че тази верига е кодиращата. В другата (комплементарната) ще имаш НАВИ, което означава, че тази верига няма да се транскрибира защото е безмислена. И съотвено ензима си "избира" кодиращата.

Ами ако и в другата верига случайно някъде се намира ИВАН тогава какво става?
Някъде бях чел че има инвертирани повтарящи се сегменти при тях значи дублиращата верига е "права"?

5`|---------------> 3'
________________иван________________________нави_______________
________________нави________________________иван_______________
3` <-----------------| 5`

надявам се, че тази картинка може да ти помогне да си представиш нещата!

свободните пространсва направени със spacebar-а не ги зачете и сблъска картинката в единия край, ще опитам пак, дано се получи!
`````````````5`|---------------> 3'
________________иван________________________нави_______________
________________нави________________________иван_______________
`````````````````````````````````3` <-----------------| 5`

да мисля, че се получи

Ако съм разбрал правилно идеята е че ДНК молекулата не симетрична пространствено гледана спрямо (5' -3') и (3'-5'), което и се разпознава от съответния ензим. Или с други думи за него не е все едно да се закачи за ИВАН (5' -3') или ИВАН (3'-5'). Това ли е идеята?

Идеята е, че в един участък едната верига е кодираща , а в друг участък - другата. За да познае ензима коя от двете да транскрибира му помага последователност, наречена промотор (в случая ИВАН :), която се намира пред кодиращата област. Според тази последователност ензима се позиционира върху матрицата и синтезира РНК.

Има активатори (транскр. фактори), които свързват:

- Upstream promoter elements (general transcription factors)
- Enhancer response elements (specific transcription factors)

specific transcription factors включват:

- sterioid receptors (zing finger)
- cAMP-dependent activator protein, CREB (leucine zipper)
- PPARs (zinc finger)
- Homeodomain proteins: pHOX, pPAX (helix-turn-helix)

Поздрави на клубчето.



====
There is no Dark Side of the Moon, really. Matter of fact, it’s all dark.

Мога да допълня още към транс действащите фактори , които си дала и архитектурните белтъци, към които спадат и HMG-тата. Те се свързват към малката бразда и предизвикват огъване на ДНК веригата, с което спомагат за образуването на енхансозомата и инициацията на транскрипцията.
Също така е от значение хроматин ремоделиращият комплекс , които предизвиква разрехавяване на структурата на нуклеозомите и така олеснява достъпа на активаторите до съответните последователности.
Да не забравяме и че освен активатори има и репресори.
И още един милион неща, които могат да се допълнят!