Много добре не те разбрах.. но все пак това което схванах е:
Ползваш флаш за да извикаш perl скрипт който да ти изпрати майл..като заявката която правиш е през GET...като се предполага че флаша ти кодира низа както е редно по MIME стандарта... и ти вероятно си пропуснал да го разкодираш обратно?
Ако това е проблема-ти... неразбирам защо не ползваш някой парсер... например CGI.pm който ще ти върне коректно променливите...

Но може и да не съм те разбрал правилно....