Не разбирам - икаш да си закачиш малкия диск завинаги, или само за инстлацията? Ако е завинаги - дялът му C: trqbwa да е на FAT16. Ако е мастер големият диск - важи това от предишния постинг. А ако мислиш да махнеш малкия диск след инсталацията - хич не ми е ясно какво точно имаш предвид?
В случай, че малкият е мастер, а големият е слейв и инсталираш NT, тогава компютърът ще бутва от малкия диск, както и да го сучеш после. Ако го махнеш и отане само големия - все едно да си резнеш бутсектора.
Какво имаш пред вид?

по-бързо, още по-бързо... изгорях