след като видях тва дето си го дал, мисля че причината ми е била една от двете:

If this error occurred during Windows NT Setup while reading Windows NT Setup floppy disk 2, you may have the Drive Swapping option enabled in your computer BIOS.

Using winnt /b as the installation method may present a timing issue for the disk controller. The controller is not given enough time to respond and identify itself and is therefore detected incorrectly or not at all.

Абе все тая, инсталацията на 2000 не ми направи никъв проблем, пък аз много си обичам FAT32 :-)))))