МПЕГ файловете си пазят какво е отношението на картината - примерно 16:9, 4:3 и т.н. При МПЕГ-а пиксела не е квадратен. Така че дори и картината ти да е 720:576 (5:4 отношение на пикселите) пиксела, ако е указано че картината е 16:9 то тя излиза 16:9 на екрана.
При АВИ файловете това нещо го няма, т.е. има го ама повечето плеъри и софтуерни и домашни не го ебават. Те си мислят, че пиксела е квадратен и такъв си го "рисуват", в резултат на което се получава това, което ти виждаш.

Просто в дъба сложи един филтър за resize и ще се оправят нещата.
Другия начин е да ползваш MPEG4Modifier за да оправиш размера в АВИ файла, като след това се молиш плеъра ти да го ебава.