Ти не си ли защитил входа към ftp с парола?
Или поне ограничи правата за свободния достъп - да няма достъп до чувствителни папки.
И между другото е по-добре трансфера на файлове да е през ssh - примерно с winscp. И фтп-то изобщо да не го ползваш.