Прoтеините в кравето мляко са най- трудно усвоимите протеини за човешкото тяло. Има около 30 различни вида протеини в кравето мляко, които могат да задействат алергични реакции. Храносмилателната система при човека може да увеличи този брой до 100 възможни антигена. Протеините в кравето мляко могат да нанесат увреждания на стомашно-чревните власинки, като притъпят краищата им и по този начин червата не могат да абсорбират хранителните вещества. Развиват се симптоми, които приличат на грип и които прогресират до коремни спазми и болки.

Това е често срещано при бебета със симптоми на колики, дори и при кърмени бебета. Майката може да има реакции към кравето мляко и чрез приемането му да предаде своите антигени на бебето, създавайки по този начин още едно поколение с отслабена имунна система. По-полезно за майката е да приема вода, вместо мляко, докато кърми. В кърмата на майките, които пият краве мляко и които имат бебета с колики, са открити високи нива на протеини на кравето мляко. Спирането на приема на краве мляко е помогнало на пеленачетата да намалят симптомите на колики. Коликите изглежда са се появили през последните 100 години чрез храненето на бебетата с краве мляко. Но алергиите към млякото не са новост, има записани случаи в Талмуда и древногръцките записи на лекаря Гален. Когато семействата елиминират млечните продукти от своята диета забелязват, че и други проблеми изчезват, като например колит, ушни болки, настинки, астма и хронична конгестия.