Ако все още имаш нужда от решение, един малко по-текстов подход, отколкото на колегата пръч.

Това ще ти изплюе резултата в конзола
sed -r s/"0x([0-9a-fA-F]{2,2})([0-9a-fA-F]{2,2})"/0x\\2\\1/ filename.txt

Ако искаш направо да ги размени в самия файл
sed -i -r s/"0x([0-9a-fA-F]{2,2})([0-9a-fA-F]{2,2})"/0x\\2\\1/ filename.txt

Ако това което разменяш не е във файл а идва на stdin, може да направиш pipe:

cmd_output_generator | sed -r s/"0x([0-9a-fA-F]{2,2})([0-9a-fA-F]{2,2})"/0x\\2\\1/