Малко не разбрах, та да попитам:

- Какъв Windows използваш? Имам спомени, че 9x (т.е. DOS) не може да зареди от дял на втория диск

- Как познаваш, че се стартира старото LILO? Използваш нова версия с различен prompt (примерно шарен), но си стои стария или не виждаш промените в конфигурацията, които си направила?

- Като пускаш /sbin/lilo не ти ли показва, че се инсталира, кой е активния дял и т.н. ...

- Втория диск на същия контролер ли е? Нямаш IDE + SCSI примерно, нали?