Запомни - никога не инсталирай LILO, ако си с Windows 2000 или NT!
Първо, те имат собственни boot-managers и може да ги конфигурираш.
Второ, може да си инсталираш някоя програмка за MBR. Те са огромно количество.
Третия начин е просто да си бутваш Linux от дискетка. Инсталационната програма ти предлага да я направиш още при инсталирането, нали?
Или пък направи си я сам под Linux с команда mkbootdisk или нещо от този сорт, не си спомням.
Успех, и се похвали, ако стане!!!