SCM-а всичко си го прави в базата поне по отношение на обектите, има си repository което се пази в базата, но работи и с файлове. Така че по отношение на таблици и такива неща работи много добре, това всъщност е една част от един друг софтуер - Oracle Designer, който е отделен впоследствие и доразвит за да се използва и с JDeveloper.
А за сторнатите процедури поне за нас не е удобно на файлове, щото става куцо като се прави версия - трябва да сваляш всичко на файлове и т.н. А иначе не е проблем че се пазят само в компилиран вид, щото това значи че са в backup-а на базата и няма опасност да се изгубят.
Абе с две думи, няма пълен tool за такова нещо. Аз с VSS не съм работил, но не ми се вярва да стават версиите на сторнатите процедури без сваляне на файлове. Кофти