Можеше и да го поправиш без да преинсталираш.
А това с пълния диск трябва да го решиш ако искаш да работи изобщо.
Както и на много други сървъри на MySQL му трябва празно място по диска.

А пък ако го стартираш със --skip-locking както си е нормално съвсем естествено таблиците ще се чупят всеки път като не ти стигне мястото.

Имай предвид, че за доста неща MySQL създава временни таблици, като част от тях са в директорията на базата, други са в tmpdir
Затова разгледай в mysqlsrc/support-files/ примерчетата за my.cnf - доста подсказки има

Linux is like a wigwam - No Windows, No Gates, Apache inside