Обикновено DLL- ите използвани от EXE са в неговата директория.
Или в Sistem32 или в директориите в които се търси и т.н.
Аз си слагам DLL- ите при EXE- то.
Тук не става въпрос каде са файловете на различните проекти.
Те могат да са навсякъде.
Проблема идва от това, че EXE- то е пускано с DLL- а/ите без Delphi.
Може би Win- а да е кеширал файла на DLL- a или Delphi се шашка.
Точно обяснение не мога да дам, но когато рестартираш Delphi, нещата се оправят. За по сигурно изтривам DLL- а/ите и ги компилирам наново.